ماجرای "روز استقلال: بازخیز" 20 سال پس از اتفاقات قسمت نخست روایت می‌شود. جایی که مردم کره‌ی زمین پس از شکست بیگانگان فضایی موفق شدند با استفاده از تجهیزات نظامی فضایی‌ها سیستم دفاعی سیاره را به شدت بالا ببرند. اما اینبار پس از گذشت 20 سال فضایی‌ها قوی‌تر از قبل و با تکنولوژی‌ای به اندازه‌ی دو دهه پیشرفته‌تر باز هم برای نابودی انسانها به کره‌ی زمین حمله می‌کنند.